处理农村拆迁补偿款纠纷的方式是:
1、行政复议,认为行政主体的具体行政行为侵犯其合法权益,依法向法定的行政复议机关提出复议申请;
2、民事诉讼,可以起诉民事侵权,要求停止侵害、赔偿损失、恢复原状;
3、协调裁决,由县级以上地方人民政府协调;协调不成的,由批准征用土地的人民政府裁决。法律依据:《民事诉讼法》第一百一十九条
起诉必须符合下列条件:
(一)原告是与本案有直接利害关系的公民、法人和其他组织;
(二)有明确的被告;
(三)有具体的诉讼请求和事实、理由;
(四)属于人民法院受理民事诉讼的范围和受诉人民法院管辖。