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在实践中被征收人发现征地程序违法的，合法的对抗方式是申请行政复议、提起行政诉讼、申请政府信息公开、向上级土地管理部门举报等。

法律依据：《中华人民共和国行政诉讼法》第十二条 人民法院受理公民、法人或者其他组织提起的下列诉讼：

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