网站代理合同注意事项分别有：注意网站代理合同双方的主体身份和意思表示；注意网站代理合同的标的、价格、使用期限、使用范围和使用限制等；注意网站代理合同双方的违约责任和争议解决方法等；法律规定的其他注意事项等。

法律依据：

《民法典》第四百七十条

合同的内容由当事人约定，一般包括下列条款：

（一）当事人的姓名或者名称和住所；

（二）标的；

（三）数量；

（四）质量；

（五）价款或者报酬；

（六）履行期限、地点和方式；

（七）违约责任；

（八）解决争议的方法。

当事人可以参照各类合同的示范文本订立合同。

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